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          高通量聲波基因組剪切儀高效助力人全血DNA超聲實驗應用

          更新時間:2024-08-01   更新時間:2024-08-01   點擊次數(shù):697次

            實驗目的:此次實驗樣品為人全血DNA;需要對生物DNA生物樣本需要打斷到150-300bp進行后續(xù)的測序建庫實驗,為得到這一片段長度下的樣本,需進行梯度預實驗。


            實驗設備:高通量聲波基因組剪切儀 JXDNA-500PICO

            

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            樣品前處理實驗操作過程:

            

            1.在實驗開始前,需要先提前準確好實驗超聲波剪切設備以及實驗所需應用的耗材和若干的實驗樣品


            2.將適配器放入水槽中,再打開冷水機對其進行預冷直至4度

            

            3.對生物樣本進行稀釋,將其稀釋到同一濃度


            4.把稀釋好的同一濃度的DNA樣本按照體積梯度將其投入樣品離心管內(nèi),標好編號,震蕩離心

            

            5.把帶有樣品的離心管放入儀器的適配器內(nèi),但要注意水平配平,盡量將樣品放置在適配器外圈

            

            6.啟動儀器,調(diào)節(jié)程序運行參數(shù),設置好能量,工作時間,間隙時間,循環(huán)工作,總時長梯度為17min,20min,25min

            

            7.待儀器程序運轉(zhuǎn)結(jié)束后,即可取出樣本,進行電泳檢測

            

            實驗操作注意事項:

            

            1.同等條件下人體DNA樣本的打斷難度大于小鼠大于植物,而不同的實驗樣品需單獨進行預實驗,不可混用實驗結(jié)果

            

            2.注意樣品離心管內(nèi)的樣本體積,需確保儀器內(nèi)水位要蓋住樣品

            

            3.離心管需要配平,適配器壓蓋禁止傾斜,避免樣本開蓋污染


            4.冷水機需要提前打開預冷,水流循環(huán)要調(diào)整穩(wěn)定不能過于激烈

            

            樣品前處理實驗結(jié)果:


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            綜上結(jié)果可見,樣品投入量能影響檢測熒光強度,超聲打斷時間能影響片段長度。綜合下機樣品的片段長度和熒光強度,以及片段集中性,選擇20μL打斷25min作為實驗條件。


            在高通量測序樣本制備過程中,DNA片段化處理是一個核心步驟。因此隨機、準確、集中無偏差的DNA片段化是保證DNA文庫質(zhì)量和均一性的關鍵一步。高通量聲波基因組剪切儀采用等溫、非接觸的方式對樣品進行打斷、勻漿和混合,為DNA片段化又提供了新的研究手段,進一步推動了分子生物學的研究發(fā)展。

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